שקיות נייר קראפט נמצאות בשימוש נרחב בתחומים שונים בשל הידידותיות לסביבה, העמידות, העלות הנמוכה והמרקם הטבעי שלהן. בקמעונאות ובקניות, הם משמשים לשקיות קניות ממותגות, כמו בחנויות בגדים, חנויות ספרים/כלי כתיבה וחנויות יוקרה; בסופרמרקטים ובחנויות נוחות לאריזות מזון בתפזורת ואריזות תוצרת טרייה; ובטייק אאוט וקייטרינג לאריזת המבורגר/כריכים וקפה/תה חלב. באריזות מזון הם משמשים לאריזת מוצרי מאפה, כמו במאפיות ובחנויות עוגות; לאריזות של מוצרים יבשים וחטיפים, כגון אריזות אגוזים/פירות יבשים ואריזות תה; ולאריזות מזון קפוא, כגון כופתאות/וונטונים קפואים ואריזות גלידה.
בתחום המתנות והקידום, הם משמשים לאריזת מתנות לחג, כגון חג המולד ויום האם/יום האהבה; מתנות מותאמות אישית לחברות, כגון מתנות לתערוכה ומתנות להערכת לקוחות; ואריזות קידום מכירות לאירועים. בתחום התעשייתי והלוגיסטיקה הם משמשים לאריזת חלקים וכלים, כגון רכיבים אלקטרוניים וכלי חומרה; עבור אריזות מסמכים וארכיונים, כגון חוזים/אישורים ושרטוטים/טיוטות עיצוב; וכחומרי מילוי לוגיסטיים. בתחום הלייף סטייל והיצירתי הם משמשים לאחסון ביתי, כמו אחסון צעצועים וארגון בגדים; מלאכת יד בעצמך; וכאלטרנטיבה ידידותית לסביבה, כמו אריזת כלי אוכל חד פעמיים ומיון פסולת.
בהשפעת איסור הפלסטיק, התעשייה הרפואית ניסתה להחליף שקיות ניילון בשקיות נייר קראפט, אך החסרונות היו ברורים. תרופות תוך ורידי ותרופות-גדולות הן כבדות יחסית, הדורשות שקיות נייר- באיכות גבוהה; שקיות נייר עבות יותר יעלו את העלות של כל שקית נייר קראפט ב-60%-70%. אספקת שקיות נייר קראפט עבות יותר ללא תשלום מגדילה את עלויות ניהול בית החולים, בעוד שמכירתן לחולים במחיר עלולה לגרום לבעיות. יתר על כן, בשימוש בפועל, שקיות נייר הרבה פחות נוחות משקיות ניילון.